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来自研究机构

研究人员证实了新型COVID-19检测的速度、简单性和灵敏度

日期:
2021年8月17日
来源:
伯明翰大学
简介:
研究人员发表了一项三方比较研究,以证实逆转录酶无指数扩增反应(RTF-EXPAR)方法与PCR和LAMP测试一样敏感,但速度更快。该研究表明,RTF-EXPAR方法在10分钟内将10股RNA转化为数十亿份DNA拷贝,使用的是一锅分析,与目前使用的测试方法相比,它与更基本的台式设备兼容。
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英国伯明翰大学的研究人员证实了一种新型的高灵敏度新冠病毒检测方法的速度、准确性和简单性,这种方法可以在娱乐场所、机场到达航站楼以及没有临床检测实验室的偏远地区部署。

科学家们使用了一项三向比较研究,以证实指数扩增反应(EXPAR)方法与目前在医院环境中使用的PCR和LAMP测试一样敏感,但速度更快。伯明翰新冠病毒检测被称为RTF-EXPAR,即使在病毒水平较低的情况下,目前的侧流检测效果较差,样本到信号的时间也不到10分钟。

生物科学学院的Tim Dafforn教授和化学学院的Jim Tucker教授与研究生Jake Carter和癌症与基因组科学研究所的Andrew Beggs教授合作进行了这项研究,该研究于今天发表在PNAS

聚合酶链反应和LAMP检测都能检测到病毒RNA,从口腔和鼻腔提取的拭子中可能存在极低水平的病毒RNA。这些测试采用两步过程,首先将RNA转化为DNA(称为逆转录的过程),然后将材料“放大”多次,以便在样品中检测到。

蒂姆·达福恩教授说:“与没有这些步骤的抗原检测(如侧流检测)相比,逆转录和扩增步骤都减缓了现有的基于核酸检测的COVID检测。然而,虽然这使得横向流动测试比基于PCR和LAMP的测试更快,但反过来它们通常不那么敏感。理想的测试是既足够灵敏又足够快速——我们的测试,称为RTF-EXPAR,实现了这一目标。

RTF- expar通过两种方式实现了这一壮举——首先,该分析团队设计了一种新的rna - dna转化步骤,避免了逆转录,使其无逆转录(RTF)。其次,他们产生读出信号的扩增步骤使用EXPAR,这是一种替代PCR和LAMP的DNA扩增过程。

Dafforn教授补充说:“EXPAR在单一温度下扩增DNA,从而避免了PCR中冗长的加热和冷却步骤。然而,LAMP也使用单一温度进行扩增,EXPAR是一个更简单和更直接的过程,其中更小的链被扩增。这使得EXPAR不仅是PCR,而且是LAMP更快的DNA扩增技术。”

该研究表明,RTF-EXPAR方法在10分钟内将10股RNA转化为数十亿份DNA拷贝,使用的是一锅分析,与目前使用的测试方法相比,它与更基本的台式设备兼容。

RTF-EXPAR在信号检测时间上也比PCR和基于lamp的检测方法有了显著的改进。在低浓度RNA(7.25拷贝/µL)下,PCR检测到信号的时间为42.67(±0.47)分钟,LAMP为11.25(±0.20)分钟,EXPAR为8.75(±0.35)分钟。在病毒RNA高浓度(1450拷贝/µL)时,PCR检测到信号的时间为34.00(±0.00)分钟,LAMP为11.25(±0.20)分钟,EXPAR为3.08(±0.42)分钟。

确定最优序列显然是EXPAR方法发展的重要一步,而本研究中检测到的序列,来自于Orf1ab该基因已被证明在所有当前的COVID变体中都是保守的。然而,如果出现新的变异,或检测流感、呼吸道合胞病毒(RSV)或埃博拉等需要近患者检测以防止更广泛传播的其他病毒性病原体,可以迅速调整RTF-EXPAR方法。

伯明翰大学的外科研究实验室已经对这种检测方法进行了测试。安德鲁·贝格斯教授的团队进行了这项测试,他评论说:“测试使用的拭子含有大流行期间常见的典型病毒载量,并且有6分钟的截止时间。”分析表明,RTF-EXPAR的敏感性与定量PCR检测相当,阳性预测值为89%,阴性预测值为93%。我们希望在不久的将来公布这项测试的全部结果。”

该团队目前正在寻求商业合作伙伴,以获得快速许可,使RTF-EXPAR测试尽可能广泛地可用。

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故事来源:

材料所提供的伯明翰大学注:内容可能会根据风格和长度进行编辑。


期刊引用

  1. Jake G. Carter, Lorea Orueta Iturbe, Jean-Louis H. A. Duprey, Ian R. Carter, Craig D. Southern, Marium Rana, Celina M. Whalley, Andrew Bosworth, Andrew D. Beggs, Matthew R. Hicks, James H. R. Tucker, Timothy R. Dafforn。利用无逆转录指数扩增反应(RTF-EXPAR)超快速检测SARS-CoV-2 RNA美国国家科学院院刊, 2021;118 (35): e2100347118 DOI:10.1073 / pnas.2100347118

引用此页

伯明翰大学。“研究人员证实了新冠病毒检测的速度、简单性和灵敏度。”《科学日报》。《科学日报》,2021年8月17日。< www.koonmotors.com/releases/2021/08/210816191328.htm >。
伯明翰大学。(2021年8月17日)。研究人员证实了新型COVID-19检测的速度、简单性和灵敏度。《科学日报》.2023年6月17日检索自www.koonmotors.com/releases/2021/08/210816191328.htm
伯明翰大学。“研究人员证实了新冠病毒检测的速度、简单性和灵敏度。”《科学日报》。www.koonmotors.com/releases/2021/08/210816191328.htm(2023年6月17日访问)。

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