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导致covid -19的新型病毒在全球感染中占主导地位

刺突中D614G变化的病毒与原株竞争,但可能不会使患者病情加重

日期:
2020年7月2日
来源:
能源部/洛斯阿拉莫斯国家实验室
简介:
新的研究表明,SARS-CoV-2冠状病毒基因组的一种特定变化在细胞培养中更具传染性,这种变化以前与病毒传播和COVID-19的传播增加有关。
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这项研究今天发表在杂志上细胞研究表明,SARS-CoV-2冠状病毒基因组的一种特异性变化在细胞培养中更具传染性,这种变化以前与病毒传播和COVID-19的传播增加有关。这种名为D614G的变异使病毒的“刺突”蛋白发生了微小但有效的变化,病毒利用这种蛋白进入人体细胞。

洛斯阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory)的理论生物学家、该研究的主要作者贝蒂·科尔伯(Bette Korber)指出:“D614G变异在4月初首次引起我们的注意,当时我们观察到一种惊人的重复模式。在世界各地,即使当地有许多原始形式的流行病例,在D614G变体被引入一个地区后不久,它就成为流行形式。”

来自GISAID COVID-19病毒序列数据库样本的地理信息能够跟踪这种高度复发的模式,即病毒种群从原始形式转变为D614G变体。这种情况发生在每个地理层面:国家、次国家、县和市。

支持这些初步结果的两个独立的实验证据包含在今天的论文中。由拉霍亚研究所的Erica Ollmann sapire教授和杜克大学的David Montefiori教授领导的这些额外实验表明,D614G的变化增加了病毒在实验室中的传染性。这些新的实验,以及更广泛的序列和临床数据和改进的统计模型,在报告中提出细胞纸。为了确定这种变化的全部含义,还需要做更多的体内研究。

SARS-CoV-2病毒总体突变率较低(远低于导致流感和艾滋病毒-艾滋病的病毒)。D614G突变是一组四种相关突变的一部分,这四种突变似乎出现过一次,然后作为一组一致的突变一起在世界各地传播。

“对我来说,这很了不起,”该研究的作者之一、洛斯阿拉莫斯的威尔·费舍尔(Will Fischer)评论说,“不仅通过仔细观察序列数据就能检测到这种传染性的增加,而且我们的实验同事能在这么短的时间内用活病毒证实这一点。”

幸运的是,“谢菲尔德大学的这篇论文中的临床数据表明,尽管感染新型G病毒的患者比感染D病毒的患者携带更多的病毒拷贝,但疾病的严重程度并没有相应的增加,”盖茨基金会支持的冠状病毒免疫治疗联盟(CoVIC)的负责人萨菲尔说。

科尔伯指出:“这些发现表明,新形式的病毒可能比原始形式更容易传播——无论这一结论最终是否得到证实,它都突显了已经存在的好主意的价值:戴口罩和保持社交距离。”

来自洛斯阿拉莫斯国家实验室、杜克大学和谢菲尔德大学的研究合作伙伴最初在2020年4月的预印本中在bioRxiv网站上发表了关于这一分析的工作。这项工作还包括对谢菲尔德的COVID-19患者的观察,这表明D614G变异与上呼吸道较高的病毒载量有关。

Korber说:“世界各地的研究人员正在通过GISAID病毒序列数据库迅速提供他们的病毒序列数据,因此有可能在全球范围内追踪SARS-CoV-2的进化。”目前,通过这个项目可以获得数以万计的序列,这使得Korber和研究小组能够确定D614G变体的出现。

GISAID的建立是为了鼓励流感研究人员之间的合作,但在疫情早期,该联盟建立了一个SARS-CoV-2数据库,该数据库很快成为全球研究人员共享疫情序列的事实上的标准。

这项名为“追踪SARS-CoV-2峰值的变化:D614G增加COVID-19病毒传染性的证据”的研究得到了英国研究与创新(UKRI)医学研究委员会(MRC)部分国家卫生研究所(NIHR)的支持;基因组研究有限公司,作为威康桑格研究所运作;CoVIC, COVID-19治疗加速器INV-006133,由比尔和梅林达·盖茨基金会、万事达卡、惠康支持;私人慈善机构的支持,以及奥弗顿家族的支持;来自Emergent Ventures的FastGrant,用于支持COVID-19研究;和国家过敏和传染病研究所,国家卫生研究院,卫生和人类服务部,根据机构间协议。AAI12007-001-00000,以及洛斯阿拉莫斯实验室指导研究与发展计划。

其他研究作者包括S. Gnanakaran, H. Yoon, J. Theiler, W. Abfalterer, N. Hengartner, E.E. Giorgi, T. Bhattacharya, B. Foley, K.M. Hastie, M.D. Parker, D.G. Partridge, C.M. Evans, T.M. Freeman, T.I. de Silva, C. McDanal, L.G. Perez, H. Tang, A. moonwalker, S.P. Whelan, C.C. LaBranche。

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故事来源:

材料所提供的能源部/洛斯阿拉莫斯国家实验室注:内容可能会根据风格和长度进行编辑。


期刊引用

  1. B. Korber, W.M. Fischer, S. Gnanakaran, H. Yoon, J. Theiler, W. Abfalterer, N. Hengartner, E.E. Giorgi, T. Bhattacharya, B. Foley, K.M. Hastie, M.D. Parker, D.G. Partridge, C.M. Evans, T.M. Freeman, T.I. de Silva, C. McDanal, L.G. Perez, H. Tang, A. moonwalker, S.P. Whelan, C.C. LaBranche, E.O. Saphire, D.C. Montefiori代表谢菲尔德COVID-19基因组学集团。追踪SARS-CoV-2峰值的变化:D614G增加COVID-19病毒传染性的证据细胞2020年7月2日;DOI:10.1016 / j.cell.2020.06.043

引用此页

能源部/洛斯阿拉莫斯国家实验室。“导致covid -19病毒的新变种主导着全球感染:Spike中D614G变化的病毒与原始菌株竞争,但可能不会使患者病情加重。”《科学日报》。《科学日报》,2020年7月2日。< www.koonmotors.com/releases/2020/07/200702144054.htm >。
能源部/洛斯阿拉莫斯国家实验室。(2020年7月2日).导致covid -19病毒的新变种在全球感染中占主导地位:Spike中D614G变化的病毒与原始菌株竞争,但可能不会使患者病情加重。《科学日报》.2023年6月22日检索自www.koonmotors.com/releases/2020/07/200702144054.htm
能源部/洛斯阿拉莫斯国家实验室。“导致covid -19病毒的新变种主导着全球感染:Spike中D614G变化的病毒与原始菌株竞争,但可能不会使患者病情加重。”《科学日报》。www.koonmotors.com/releases/2020/07/200702144054.htm(2023年6月22日访问)。

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