单细胞RNA测序是基于对单个细胞中基因组活性区域产生的分子转录本的研究。根据细胞的类型和发育阶段，细胞会激活从RNA分子中读取并翻译成蛋白质的不同基因组。特定细胞中每个基因的mRNA分子(也称为转录本)的数量可以告诉我们它们的身份以及它们对内部或外部信号的生理反应。这些可能是疾病、衰老过程、环境影响或对药物的反应。然而，检测仅在中等至低浓度下表达的基因对当前单细胞RNA测序技术构成了主要挑战。它们主要检测所谓的管家基因，与受调节的基因不同，管家基因是不断表达的。

干细胞研究所Micha Drukker博士和博士生Fatma Uzbas的团队开发的BART-Seq方法通过丰富选定的转录本进行测序来解决这一问题。BART-Seq代表“Barcode Assembly for Targeted Sequencing”。引物集和DNA条形码结合在一起，这样它们就可以同时扩增感兴趣的基因的转录本。Micha Drukker解释说:“我们已经开发出一种新的方法，通过简单的合成反应来用DNA条形码索引引物。”因此，测序转录本可以追溯到它们起源的单个细胞。由于分析的重点是选定的基因，因此有可能获得这些基因的高分辨率信息，从而单独表征每个细胞。

该方法价格低廉，不需要专门和昂贵的仪器。任何拥有下一代测序设备的研究小组都可以使用BART-Seq对单细胞进行分析，也可以对来自数千个样本的RNA或基因组DNA散装样本进行分析。

Drukker的团队与Helmholtz centrum m nchen计算生物学研究所的Philipp Angerer、Nikola m ller和Fabian Theis一爱博网投领导者起开发了用于设计引物和条形码以及分析测序数据的软件。为了使所有的研究小组都能使用该方法，该软件在互联网上免费提供。

Micha Drukker和他的团队同事希望他们的方法将成为基础研究和应用研究工具包的一个组成部分。项目对药物筛选，如培养反应的测定?将细胞转化为药物，或使用CRISPR-Cas9的精确基因编辑技术都可以从BART-Seq中受益匪浅。