一种使用最新技术的高度创新的方法产生了SARS-CoV-2病毒和人类蛋白质相互作用的全面清单,其中一种相互作用表明病毒直接影响调节人体免疫系统的蛋白质。
这项研究发表在10月10日的《新冠病毒-2-人类蛋白质-蛋白质相互作用组揭示COVID-19病理生物学和潜在的宿主治疗靶点》中爱博网投领导者自然生物技术为研究和理解COVID-19背后的生物学,以及确定针对蛋白质结合位点的新疗法开辟了无数新的途径。爱博网投领导者
在这项研究中,研究人员确定了23种候选药物,每种药物都有可能破坏病毒与宿主的结合位点。在初步实验中,其中一种药物,一种被fda批准用于治疗血压的β受体阻滞剂卡维地洛,毒性低,在抑制感染SARS-CoV-2的人肺细胞系的病毒感染方面非常有效。此外,对SARS-CoV-2感染者记录的分析显示,服用卡维地洛治疗血压的患者感染SARS-CoV-2的风险降低了17%,这表明它无意中提供了一些保护。
“我们对SARS-CoV-2病毒与人类蛋白质相互作用网络有了新的、更全面的认识,它显示了病毒蛋白质如何劫持人类蛋白质,并[揭示了]病毒感染、复制和传播所需的途径,”农业与生命科学学院(CALS)计算生物系和威尔细胞与分子生物学研究所教授于海远说。爱博网投领导者Yu和Cleveland Clinic副教授程飞雄是该论文的资深作者。
他说,所描述的方法也可以应用于任何病毒或病原体。研究人员已经开始使用这些技术来更好地了解蛋白质的相互作用,并研究蚊子传播的寨卡病毒的治疗方法。
在这项研究中,研究人员结合了两种互补的最先进的方法,以全面了解SARS-CoV-2病毒蛋白与人类宿主蛋白之间的相互作用。第一种方法使用定量蛋白质组学技术,在人类细胞中人工表达SARS-CoV-2中发现的每种病毒蛋白,以观察病毒招募了哪些宿主蛋白和复合物。在第二种被称为Y2H的方法中,研究人员使用了他们的病毒和人类蛋白质库。然后将每组中的单个蛋白质配对在一起。这项技术使研究人员能够观察到哪些基因对彼此有亲和力并相互接触;当它们相互作用时,这种配对通常是短暂的。
“一些最重要的监管相互作用是短暂的,”Yu说。“一种蛋白质只有在合适的条件下才能找到它需要结合的东西,然后它就会分解。”
该技术揭示了579种人类蛋白质和28种SARS-CoV-2蛋白质之间的739种高可信度蛋白质相互作用,验证了218种已知的与SARS-CoV-2相互作用的人类蛋白质,并揭示了361种新的蛋白质。研究人员还发现了一种病毒蛋白和一种人类转录因子之间的相互作用,这种相互作用直接参与了免疫反应基因的开启和关闭。这一发现可能为病毒如何逃避宿主免疫提供线索。
虽然研究中使用的最相关的细胞来自肺部,但它们很难在培养中生长。因此,之前的SARS-CoV-2研究使用了肾脏T细胞。在这项研究中,研究人员首次使用了结肠细胞系。“有证据表明,这些细胞系在表面表达感染所必需的两种关键标记蛋白,”Yu说,并补充说肾T细胞不表达这些标记。
在接下来的步骤中,Yu及其同事将研究SARS-CoV-2如何调节人类基因表达,特别是在逃避免疫方面;他们正在与分子生物学和遗传学(CALS)教授John Lis,分子生物学和遗传学(CALS)教授Cedric Feschotte,化学病毒学教授Luis Schang(兽医学院)和其他几个康奈尔小组合作,跟进其他候选药物,其中一些似乎有效。爱博网投领导者
这项研究主要得到了美国国家老龄化研究所、美国国家普通医学科学研究所和康奈尔大学SARS-CoV-2种子快速反应基金的支持。Yu说,后者在收集启动这项研究的初步数据以及支持大流行期间的持续合作方面发挥了作用。
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