2020年2月，在巴塞尔大学和大学医院建立了一个Covid-19患者队列，以前瞻性监测一系列Covid-19诊断手段和潜在治疗方法，包括超说明书使用羟氯喹和洛匹那韦/利托那韦。

一个研究小组前瞻性地监测了Covid-19患者的洛匹那韦血浆水平。该研究的第一作者、巴塞尔大学实验医学教授Catia Marzolini说:“考虑到在这些患者中观察到实质性的炎症，以及之前的研究表明全身炎症抑制药物代谢，我们有理由研究炎症对洛匹那韦和羟氯喹血浆水平的影响。”

作者在他们的研究中纳入了92名患者。这项研究的共同负责人Parham Sendi教授总结了主要发现如下:首先，洛匹那韦的血浆水平比HIV患者通常观察到的高两到三倍以上。羟氯喹水平在正常范围内。其次，血液中炎症标志物水平与洛匹那韦血浆水平之间存在显著相关性。第三，当使用白细胞介素-6抑制剂tozizumab阻断炎症时，洛匹那韦血浆水平明显低于未使用tozizumab治疗的患者。

这些结果清楚地表明药物代谢酶(细胞色素P450 3A)受到全身性炎症的抑制。作者指出:“由于药物水平升高和相关毒性的风险，在给Covid-19患者开CYP3A4底物如洛匹那韦/利托那韦或任何其他治疗指数较窄的药物时，建议谨慎。”

重要的是，从血浆中的洛匹那韦和羟氯喹浓度，研究小组计算出肺室中相应的浓度，肺室是SARS-CoV-2感染的解剖部位。结果强烈表明，这两种药物不太可能达到足够的浓度来抑制病毒在肺部的复制。

世卫组织接受了团结试验国际指导委员会的建议，于2020年7月4日停止试验的羟氯喹和洛匹那韦/利托那韦组。Manuel Battegay教授是这项研究的共同负责人，也是巴塞尔大学医院传染病和医院流行病学部门的负责人，他提到，研究结果为停止洛匹那韦/利托那韦治疗的基本原理提供了重要的药理学和抗病毒见解。事实上，他们补充了为什么羟氯喹和洛匹那韦对SARS-CoV-2无效的科学推理。