LSTM的科学家使用了一种生物信息学方法来整合来自蚊子杀虫剂抗性多项研究的信息,并发现了许多以前未被认识到的重要抗性机制。
发表在自然通讯英厄姆博士及其同事利用专业计算机编程来更好地了解蚊子对目前公共卫生杀虫剂产生抗药性的机制。她说:“在与疟疾和其他媒介传播疾病的斗争中,我们能够充分了解蚊子种群如何产生杀虫剂抗性是非常重要的。过去,人们对特定的基因家族进行了大量的研究,这些基因家族被认为是抗药性的关键,然而,通过数据整合方法,我们发现还有许多其他机制在起作用,我们认为这些机制在清除杀虫剂方面很重要。”
杀虫剂耐药性是对全球公共卫生的重大威胁,降低了病媒控制工作的效力,目前病媒控制工作严重依赖蚊帐和室内残留或空中喷洒杀虫剂。耐药性在主要病媒中广泛存在,包括负责传播疟疾寄生虫的病媒按蚊。
了解这种耐药性的原因对于制定耐药性管理战略和为开发新杀虫剂提供信息至关重要。目前的研究比较了从撒哈拉以南非洲地区抗性和易感按蚊种群中收集的31个数据集的基因表达模式,以确定模式并深入了解杀虫剂抗性的机制
LSTM教授希拉里·兰森是该论文的资深作者。她说:“在过去几十年里,疟疾死亡人数的大规模减少大部分是使用杀虫剂的结果。杀虫剂抗药性的增加对这些基本工具构成了可信的威胁。这篇论文阐述了蚊子已经发展出多种防御杀虫剂的方法;这方面的知识是制定应对耐药性战略的关键。”
论文中使用的数据已汇集在一起,并可在LSTM托管的一个新的基于网络的应用程序中使用。该应用程序名为IR-TEx(杀虫剂抗性转录记录探索者),可免费访问,可供其他研究人员和政策制定者使用,以更好地了解撒哈拉以南非洲不同地区的抗药性机制。英厄姆博士设计的这款应用程序以一种更容易理解的格式呈现数据,对于那些不精通编程的人来说更容易使用。她说:“我们一直决定,这项工作完全开放,让其他人利用它来解决他们自己的研究问题。它可以按蚊子种类、国家和杀虫剂类别进行全面搜索,并可下载。它是用户友好的,适合那些在现场工作的人使用。”
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