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研究将COVID-19与中国市场的野生动物销售联系起来,发现其他情况极不可能

日期:
2022年7月26日
来源:
亚利桑那大学
简介:
根据对新冠肺炎早期病例的地点和病毒序列分析,大流行始于中国武汉的华南市场,该市场上出售的活体动物可能是传染源。基因组研究显示,SARS-Cov-2病毒在两个不同的场合感染了人类。
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完整的故事

一个国际研究小组证实,华南海鲜批发市场出售的活体动物可能是新冠肺炎大流行的源头。自近三年前爆发以来,新冠肺炎疫情已夺去640万人的生命。

在亚利桑那大学(University of Arizona)病毒进化专家迈克尔·沃罗贝(Michael Worobey)的带领下,国际研究团队已经将大流行的起点追溯到中国武汉的市场,在大流行开始之前,那里的狐狸、貉和其他易感染病毒的活哺乳动物被活体出售。他们的研究结果在周二的《科学》杂志上发表了两篇论文科学今年2月,该书以预印本的形式发行。

这些出版物后来经过同行审查,并包括额外的分析和结论,几乎消除了被认为是大流行起源的其他可能情况。此外,作者得出结论,第一次从动物传播给人类可能发生在2019年11月下旬华南市场的两次独立传播事件中。

一项研究仔细检查了首批已知COVID-19病例的地点,以及从市场不同地点的表面采集的拭子样本。另一项研究侧重于在中国大流行的头几周从COVID-19患者收集的样本中提取的SARS-CoV-2的基因组序列。

第一篇论文由加利福尼亚州圣地亚哥斯克里普斯研究所的Worobey和Kristian Andersen领导,研究了2019年12月疫情爆发的第一个月COVID-19病例的地理模式。该小组能够确定当月世界卫生组织确定的几乎所有174例COVID-19病例的位置,其中155例在武汉。

分析显示,这些病例主要集中在华南市场周围,而后来的病例则广泛分布在拥有1100万人口的武汉。值得注意的是,研究人员发现,在与市场没有已知联系的早期COVID患者中,有惊人比例的人住在市场附近,这意味着他们既不在那里工作,也不在那里购物。Worobey说,这支持了市场是疫情中心的观点,商贩首先被感染,并在周边地区的社区成员中引发了一系列感染。

沃罗贝说:“在一个面积超过3000平方英里的城市里,世界上最早发现COVID-19病例之一的人的家最有可能住在几个街区的地方,华南市场就在里面。”沃罗贝是亚利桑那州立大学生态与进化生物学系主任。爱博网投领导者

沃罗贝说,这一结论得到了另一项发现的支持:当作者研究2020年1月和2月后期COVID病例的地理分布时,他们发现了一种“截然相反”的模式。虽然2019年12月的病例在市场上“像靶心一样”,但后来的病例恰好发生在武汉人口密度最高的地区。

沃罗贝说:“这告诉我们,病毒并不是秘密传播的。”“它确实起源于那个市场,并从那里蔓延开来。”

Worobey和他的合作者对他们早期的发现进行了一个重要的补充,他们提出了一个问题,即卫生当局在市场周围发现病例是否仅仅是因为他们在那里寻找。

“重要的是要认识到,所有这些病例都是因住院而被发现的,”Worobey说。“没有一个是轻微的病例,这种病例可能是通过敲开住在市场附近的人的门,询问他们是否感到不舒服来确诊的。换句话说,这些病人被记录下来是因为他们在医院,而不是因为他们住在哪里。”

为了排除任何可能存在的偏见,Worobey的团队采取了进一步的措施:从市场开始,他们开始从分析中删除案例,随着他们与市场的距离越来越远,再次运行统计数据。结果是:即使三分之二的病例被移除,结果还是一样的。

沃罗贝说:“即使在这种情况下,大多数病例都被排除了,我们发现,如果这些最早的COVID病例与市场之间没有地理相关性,那么剩下的病例离市场更近。”

该研究还研究了华南市场关闭后从地板和笼子等市场表面采集的棉签样本。SARS-CoV-2检测呈阳性的样本与出售活体野生动物的摊位显著相关。

研究人员确定,目前已知对SARS-CoV-2易感的哺乳动物,包括红狐、猪獾和貉,在首次记录的COVID-19病例之前的几周内,在华南市场上被活体出售。科学家们绘制了一幅详细的市场地图,并显示中国研究人员在2020年初报告的sars - cov -2阳性样本与市场的西部地区有明显的关联,西部地区在2019年底出售活的或新鲜屠宰的动物。

“上游事件仍然模糊不清,但我们对现有证据的分析清楚地表明,此次大流行源于2019年11月下旬华南海鲜批发市场出售的动物最初的人类感染,”安德森说,他是这两项研究的共同资深作者,也是斯克里普斯研究所免疫学和微生物学系的教授。爱博网投领导者

病毒很可能不止一次从动物传染给人类

第二项研究是对早期病例的SARS-CoV-2基因组数据进行分析,由加州大学圣地亚哥分校的乔纳森·佩卡尔和乔尔·韦特海姆、加州大学洛杉矶分校的马克·苏查德以及安德森和沃罗贝共同领导。

研究人员将流行病模型与基于最早采样基因组的病毒早期进化分析结合起来。他们确定,这场大流行最初涉及两种微妙不同的SARS-CoV-2谱系,可能是由2019年11月和2019年12月在华南市场至少两次不同的人与动物感染引起的。分析还表明,在此期间,市场上还有许多其他动物与人之间的病毒传播,但没有在记录的COVID-19病例中表现出来。

作者使用了一种称为分子钟分析的技术,该技术依赖于基因突变随时间发生的自然速度,为SARS-CoV-2病毒谱系的进化建立了一个框架。他们发现,将病毒单次引入人体而不是多次引入人体的设想与分子钟数据不一致。Worobey说,早期的研究表明,这种病毒的一个谱系——被命名为A,与蝙蝠中的病毒亲戚密切相关——产生了第二个谱系,被命名为b。根据新的数据,更有可能的是,这两个谱系在不同的场合从动物传染给人类,都是在华南市场。

“否则,与B系病毒相比,A系病毒将不得不缓慢进化,这在生物学上是没有意义的,”Worobey说。

这两项研究提供的证据表明,COVID-19起源于华南市场上的动物向人类的跳跃,可能是在中国野生或农场中携带冠状病毒的蝙蝠传播给这些动物之后。研究人员说,展望未来,科学家和政府官员应该更好地了解中国和其他地方的野生动物贸易,并促进对市场上出售的活体动物进行更全面的检测,以降低未来发生流行病的风险。

这项研究的资金由美国国立卫生研究院和美国国家科学基金会提供。

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故事来源:

材料所提供的亚利桑那大学。丹尼尔·斯托尔特(Daniel Stolte)原创。注:内容可能会根据风格和长度进行编辑。


期刊引用

  1. Michael Worobey, Joshua I. Levy, Lorena Malpica Serrano, Alexander Crits-Christoph, Jonathan E. Pekar, Stephen A. Goldstein, Angela L. Rasmussen, Moritz U. G. Kraemer, Chris Newman, Marion P. G. Koopmans, Marc A. Suchard, Joel O. Wertheim, Philippe Lemey, David L. Robertson, Robert F. Garry, Edward C. Holmes, Andrew Rambaut, Kristian G. Andersen。武汉华南海鲜批发市场是新冠肺炎疫情的早期震中科学, 2022;DOI:10.1126 / science.abp8715
  2. Jonathan E. Pekar、Andrew Magee、Edyth Parker、Niema Moshiri、Katherine Izhikevich、Jennifer L. Havens、Karthik Gangavarapu、Lorena Mariana Malpica Serrano、Alexander Crits-Christoph、Nathaniel L. Matteson、Mark Zeller、Joshua I. Levy、Jade C. Wang、Scott Hughes、Jungmin Lee、Heedo Park、Man-Seong Park、Katherine Zi Yan Ching、Raymond Tzer Pin Lin、Mohd Noor Mat Isa、Yusuf Muhammad Noor、Tetyana I. Vasylyeva、Robert F. Garry、Edward C. Holmes、Andrew Rambaut、Marc A. Suchard、克里斯蒂安·g·安德森,迈克尔·沃罗贝,乔尔·o·韦特海姆。SARS-CoV-2多重人畜共患源的分子流行病学研究科学, 2022;DOI:10.1126 / science.abp8337

引用此页

亚利桑那大学。“研究将COVID-19与中国市场的野生动物销售联系起来,发现其他情况极不可能。”《科学日报》。科学日报,2022年7月26日。< www.koonmotors.com/releases/2022/07/220726132600.htm >。
亚利桑那大学。(2022年7月26日)。研究将COVID-19与中国市场的野生动物销售联系起来,发现其他情况极不可能。《科学日报》。2023年6月17日检索自www.koonmotors.com/releases/2022/07/220726132600.htm
亚利桑那大学。“研究将COVID-19与中国市场的野生动物销售联系起来,发现其他情况极不可能。”《科学日报》。www.koonmotors.com/releases/2022/07/220726132600.htm(2023年6月17日访问)。

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