迄今为止最全面的结直肠癌风险全基因组关联研究(GWAS)今天发表在自然遗传学他发现了40种新的基因变异,并证实了55种先前发现的标志着结肠癌风险增加的变异。
这项由弗雷德哈钦森癌症研究中心的一组研究人员领导的研究还发现了第一个罕见的保护散发性结直肠癌的变异。散发性结直肠癌没有已知的家族性综合征,占结直肠癌病例的绝大多数。总之,这些发现是朝着创建个性化筛查策略和更好地为结直肠癌药物开发提供信息迈出的重要一步。
Fred Hutch公共卫生科学部副主任、Fred Hutch 40周年捐赠主席获得者Ulrike“Riki”Peters博士说:“只有通过与来自世界各地机构的合作伙伴合作,才能进行如此大规模的研究。”“了解结直肠癌的基因结构将彻底改变我们评估这种疾病的风险和治疗方式,这是美国第二大致命癌症。”2009年,Peters发起并领导了结直肠癌遗传学和流行病学联盟,这是世界上最大的结直肠癌分子遗传学联盟。
这些发现也阐明了研究作者所说的药物开发“错失的机会”。该研究确定了几个基因座,即基因在染色体上的物理位置,靠近拟议的药物靶点,以及以前不知道与结直肠癌有因果关系的途径中的基因。这组作者认为,利用GWAS的结果为癌症药物开发提供信息,可以提高药物开发的成功率,甚至可以为高危人群开发化学预防药物。
“利用GWAS的结果发现抗癌药物的靶点有很大的潜力。对于像2型糖尿病和心脏病这样的疾病,GWAS方法推动了新的生物学和潜在药物靶点的发现,”Jeroen Huyghe博士解释说,他是该研究的统计基因分析的共同负责人,也是Fred Hutch的一名工作爱博网投领导者人员科学家。“迄今为止,对癌症治疗新靶点的研究主要局限于癌细胞的分子特征。我们认为使用GWAS方法为结直肠癌药物开发提供信息是一个巨大的机会。”
来自130多个不同机构的研究人员为这项研究做出了贡献,许多研究人员通过共享数据和生物标本,使研究小组能够分析超过12.5万人的基因组,其中有58131例结直肠癌病例和38296例未患该疾病的对照参与者。参与这项研究的人数几乎是以往同类分析的两倍。
Huyghe解释说:“大规模的全基因组测序研究已经发现了数以百万计的基因变异,这些变异尚未被系统地检查是否与疾病有关。”“我们的研究利用了单倍型参考联盟面板的可用性,这是一个来自32,000多个个体的序列数据的群体参考面板。通过将这种策略与定制设计的基因分型芯片相结合,我们能够可靠地识别出罕见的变异关联信号和涉及低频变异的多个附加信号。”
以前的结直肠癌风险GWAS只关注常见的基因变异。相比之下,这项研究涉及2000多人的全基因组测序,旨在研究罕见基因变异对结直肠癌风险的影响。
“通过这项研究,我们已经将已知的结直肠癌风险变异数量增加到近100种,”该研究的第一作者之一、弗雷德·哈奇(Fred Hutch)的遗传流行病学家塔比莎·哈里森(Tabitha Harrison)说。“接下来,我们将扩大研究人群,包括来自不同种族背景的人。这将使我们更全面地了解整个人群的风险。”
该研究的作者承认研究样本存在偏见,其中91%是欧洲血统的人。
“我们在未来的研究中增加多样性是至关重要的,因为过早地使用这些发现来告知筛查指南可能会加剧结直肠癌筛查和生存率方面现有的种族差异,”该研究的共同第一作者、Fred Hutch的工作人员科学家Stephanie Bien博士警告说。
基因变异源于我们DNA的不同。大多数变异被认为是良性的,一些已知与各种疾病有关,而许多其他变异的意义尚不清楚。虽然单个基因变异对疾病风险的影响很小,但几种组合变异可能具有临床相关性,这可能对未来的个性化筛查建议产生影响。
“遗传风险处于前十分之一的个体可以从结肠镜检查中获益,”弗雷德·哈奇(Fred Hutch)的生物统计学家、该联盟的首席生物统计学家徐黎(Li Hsu)博士说。
为了评估一个人的全部风险状况,需要将遗传风险因素与其他流行病学因素(如饮食、体重和运动)结合起来。在某些情况下,低遗传风险评分可能会被不健康的生活方式因素扭曲,从而产生高总体风险概况。这类工作目前由该团队进行,他们不仅从所有研究中收集了遗传数据,而且在70多项研究中协调了许多临床和生活方式风险因素。此外,研究小组认为,可能还有数百种其他的基因变异会导致结直肠癌的风险,这些变异尚未被发现。
故事来源:
材料所提供的Fred Hutchinson癌症研究中心。原创作者:戴安·梅普斯。注:内容可能会根据风格和长度进行编辑。
引用此页: